Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjc1P28229 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms