Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af2P26369 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
U2af2P26369 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af2P26369 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af2P26369 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms