Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb7P26011 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb7P26011 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms