Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcmt1P23506 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcmt1P23506 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcmt1P23506 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcmt1P23506 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcmt1P23506 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcmt1P23506 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms