Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd8P23463 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd8P23463 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms