Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja1P23242 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja1P23242 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms