Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PparaP23204 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PparaP23204 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PparaP23204 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PparaP23204 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PparaP23204 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PparaP23204 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PparaP23204 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PparaP23204 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PparaP23204 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms