Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gna11P21278 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gna11P21278 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gna11P21278 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gna11P21278 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms