Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bmp4P21275 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bmp4P21275 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms