Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb9P20615 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms