Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou5f1P20263 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms