Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VimP20152 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VimP20152 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VimP20152 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VimP20152 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VimP20152 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
VimP20152 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VimP20152 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VimP20152 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VimP20152 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VimP20152 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VimP20152 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VimP20152 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VimP20152 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VimP20152 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms