Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms