Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnnc1P19123 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms