Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18528 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18528 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P18528 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18528 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18528 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18528 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
P18528 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P18528 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms