Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms