Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd1P13516 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms