Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms