Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp1P12032 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timp1P12032 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timp1P12032 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timp1P12032 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timp1P12032 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timp1P12032 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timp1P12032 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Timp1P12032 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timp1P12032 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Timp1P12032 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timp1P12032 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timp1P12032 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timp1P12032 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms