Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd4P10628 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms