Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
P10404 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P10404 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P10404 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P10404 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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