Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp28P10078 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp28P10078 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp28P10078 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp28P10078 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp28P10078 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms