Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Schip1P0DPB4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Schip1P0DPB4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms