Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CatspereP0DP43 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatspereP0DP43 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms