Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Calm3P0DP28 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms