Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amd1P0DMN7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms