Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Becn2P0DM65 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Becn2P0DM65 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms