Protein–RNA interactions for Protein: P0C1V4

Tmco2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco2P0C1V4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco2P0C1V4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco2P0C1V4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms