Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf2P09926 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf2P09926 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf2P09926 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms