Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms