Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtaP09225 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LtaP09225 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LtaP09225 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LtaP09225 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms