Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxb5P09079 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms