Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtkP08923 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtkP08923 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LtkP08923 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtkP08923 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtkP08923 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtkP08923 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LtkP08923 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LtkP08923 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LtkP08923 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtkP08923 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtkP08923 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtkP08923 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtkP08923 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtkP08923 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtkP08923 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtkP08923 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtkP08923 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtkP08923 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtkP08923 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtkP08923 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtkP08923 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtkP08923 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms