Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ApoeP08226 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ApoeP08226 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms