Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06336 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06336 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06336 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06336 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06336 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06336 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06336 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06336 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06336 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06336 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06336 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06336 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06336 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06336 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06336 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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