Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PdgfrbP05622 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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