Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrygdP04342 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygdP04342 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms