Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms