Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GzmbP04187 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GzmbP04187 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms