Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01878 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01878 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01878 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01878 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01878 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01878 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01878 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01878 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms