Protein–RNA interactions for Protein: P01676

Ig kappa chain V-VI region XRPC 24, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01676 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01676 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01676 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01676 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01676 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01676 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01676 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01676 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01676 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01676 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01676 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01676 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01676 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01676 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01676 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01676 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01676 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01676 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01676 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01676 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms