Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01652 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01652 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01652 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01652 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01652 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01652 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01652 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01652 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms