Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ifnb1P01575 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifnb1P01575 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms