Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3pxd2aO89032 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms