Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
F11rO88792 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
F11rO88792 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
F11rO88792 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
F11rO88792 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
F11rO88792 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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F11rO88792 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
F11rO88792 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
F11rO88792 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F11rO88792 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F11rO88792 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
F11rO88792 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F11rO88792 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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F11rO88792 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F11rO88792 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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F11rO88792 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F11rO88792 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F11rO88792 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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F11rO88792 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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F11rO88792 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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F11rO88792 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F11rO88792 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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F11rO88792 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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F11rO88792 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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F11rO88792 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F11rO88792 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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