Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms