Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klc1O88447 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc1O88447 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms