Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Xirp1O70373 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Xirp1O70373 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms