Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itgb5O70309 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms