Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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Lnx1O70263 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Lnx1O70263 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Lnx1O70263 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Lnx1O70263 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Lnx1O70263 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Lnx1O70263 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Lnx1O70263 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Lnx1O70263 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Lnx1O70263 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Lnx1O70263 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Lnx1O70263 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lnx1O70263 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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